Protein–RNA interactions for Protein: O35654

Pold2, DNA polymerase delta subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pold2O35654 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pold2O35654 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pold2O35654 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pold2O35654 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pold2O35654 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pold2O35654 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pold2O35654 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pold2O35654 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pold2O35654 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pold2O35654 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pold2O35654 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pold2O35654 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pold2O35654 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pold2O35654 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pold2O35654 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pold2O35654 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pold2O35654 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pold2O35654 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pold2O35654 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pold2O35654 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pold2O35654 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pold2O35654 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pold2O35654 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pold2O35654 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pold2O35654 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pold2O35654 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pold2O35654 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pold2O35654 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pold2O35654 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pold2O35654 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pold2O35654 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pold2O35654 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pold2O35654 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pold2O35654 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pold2O35654 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pold2O35654 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pold2O35654 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pold2O35654 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pold2O35654 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pold2O35654 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pold2O35654 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pold2O35654 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pold2O35654 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pold2O35654 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pold2O35654 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Pold2O35654 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Pold2O35654 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pold2O35654 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pold2O35654 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pold2O35654 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pold2O35654 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Pold2O35654 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pold2O35654 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pold2O35654 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pold2O35654 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pold2O35654 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pold2O35654 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pold2O35654 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pold2O35654 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pold2O35654 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pold2O35654 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pold2O35654 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pold2O35654 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pold2O35654 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Pold2O35654 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pold2O35654 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pold2O35654 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pold2O35654 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pold2O35654 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pold2O35654 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pold2O35654 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pold2O35654 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pold2O35654 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pold2O35654 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pold2O35654 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pold2O35654 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pold2O35654 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pold2O35654 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Pold2O35654 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pold2O35654 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Pold2O35654 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pold2O35654 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pold2O35654 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pold2O35654 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pold2O35654 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pold2O35654 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pold2O35654 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pold2O35654 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pold2O35654 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pold2O35654 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pold2O35654 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pold2O35654 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pold2O35654 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pold2O35654 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pold2O35654 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pold2O35654 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pold2O35654 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pold2O35654 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pold2O35654 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pold2O35654 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms