Protein–RNA interactions for Protein: O35426

Xbp1, X-box-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xbp1O35426 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xbp1O35426 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xbp1O35426 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms