Protein–RNA interactions for Protein: O35324

Sh2d1b, SH2 domain-containing protein 1B, mousemouse

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Length 132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d1bO35324 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh2d1bO35324 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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