Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Casq1O09165 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Casq1O09165 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Casq1O09165 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Casq1O09165 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Casq1O09165 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Casq1O09165 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Casq1O09165 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
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