Protein–RNA interactions for Protein: O08665

Sema3a, Semaphorin-3A, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3aO08665 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sema3aO08665 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sema3aO08665 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sema3aO08665 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sema3aO08665 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sema3aO08665 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sema3aO08665 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sema3aO08665 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sema3aO08665 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sema3aO08665 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sema3aO08665 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sema3aO08665 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sema3aO08665 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema3aO08665 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema3aO08665 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema3aO08665 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema3aO08665 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema3aO08665 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema3aO08665 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema3aO08665 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema3aO08665 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema3aO08665 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema3aO08665 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema3aO08665 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema3aO08665 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema3aO08665 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema3aO08665 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema3aO08665 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema3aO08665 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema3aO08665 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema3aO08665 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema3aO08665 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema3aO08665 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema3aO08665 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema3aO08665 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema3aO08665 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema3aO08665 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema3aO08665 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema3aO08665 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema3aO08665 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema3aO08665 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema3aO08665 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema3aO08665 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema3aO08665 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema3aO08665 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema3aO08665 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema3aO08665 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema3aO08665 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema3aO08665 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema3aO08665 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema3aO08665 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sema3aO08665 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sema3aO08665 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sema3aO08665 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sema3aO08665 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sema3aO08665 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sema3aO08665 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sema3aO08665 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sema3aO08665 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sema3aO08665 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Sema3aO08665 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sema3aO08665 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sema3aO08665 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sema3aO08665 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sema3aO08665 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sema3aO08665 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sema3aO08665 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sema3aO08665 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sema3aO08665 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sema3aO08665 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sema3aO08665 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sema3aO08665 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sema3aO08665 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sema3aO08665 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sema3aO08665 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sema3aO08665 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sema3aO08665 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sema3aO08665 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sema3aO08665 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sema3aO08665 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sema3aO08665 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema3aO08665 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema3aO08665 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema3aO08665 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema3aO08665 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema3aO08665 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema3aO08665 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema3aO08665 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema3aO08665 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema3aO08665 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema3aO08665 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema3aO08665 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema3aO08665 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema3aO08665 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema3aO08665 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema3aO08665 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema3aO08665 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema3aO08665 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema3aO08665 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema3aO08665 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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