Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

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Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MttpO08601 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MttpO08601 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MttpO08601 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MttpO08601 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MttpO08601 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MttpO08601 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MttpO08601 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MttpO08601 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MttpO08601 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MttpO08601 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MttpO08601 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MttpO08601 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MttpO08601 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MttpO08601 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MttpO08601 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MttpO08601 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MttpO08601 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MttpO08601 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MttpO08601 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MttpO08601 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MttpO08601 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MttpO08601 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MttpO08601 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MttpO08601 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MttpO08601 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MttpO08601 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MttpO08601 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MttpO08601 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MttpO08601 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MttpO08601 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MttpO08601 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MttpO08601 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MttpO08601 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MttpO08601 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MttpO08601 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MttpO08601 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MttpO08601 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MttpO08601 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MttpO08601 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MttpO08601 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MttpO08601 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MttpO08601 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MttpO08601 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MttpO08601 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MttpO08601 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MttpO08601 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MttpO08601 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MttpO08601 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MttpO08601 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MttpO08601 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MttpO08601 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MttpO08601 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MttpO08601 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MttpO08601 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MttpO08601 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MttpO08601 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MttpO08601 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MttpO08601 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MttpO08601 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MttpO08601 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MttpO08601 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MttpO08601 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MttpO08601 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MttpO08601 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MttpO08601 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MttpO08601 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MttpO08601 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MttpO08601 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MttpO08601 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MttpO08601 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MttpO08601 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MttpO08601 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MttpO08601 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MttpO08601 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MttpO08601 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MttpO08601 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MttpO08601 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MttpO08601 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MttpO08601 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MttpO08601 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MttpO08601 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MttpO08601 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MttpO08601 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MttpO08601 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MttpO08601 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MttpO08601 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MttpO08601 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MttpO08601 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MttpO08601 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MttpO08601 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MttpO08601 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MttpO08601 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MttpO08601 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MttpO08601 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MttpO08601 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MttpO08601 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MttpO08601 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MttpO08601 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MttpO08601 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms