Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Gm20918J3QN17 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Gm20918J3QN17 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Gm20918J3QN17 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20918J3QN17 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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