Protein–RNA interactions for Protein: J3QMY9

Top6bl, Type 2 DNA topoisomerase 6 subunit B-like, mousemouse

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top6blJ3QMY9 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Top6blJ3QMY9 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Top6blJ3QMY9 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Top6blJ3QMY9 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Top6blJ3QMY9 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Top6blJ3QMY9 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Top6blJ3QMY9 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Top6blJ3QMY9 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Top6blJ3QMY9 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Top6blJ3QMY9 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Top6blJ3QMY9 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Top6blJ3QMY9 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Top6blJ3QMY9 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Top6blJ3QMY9 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Top6blJ3QMY9 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Top6blJ3QMY9 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Top6blJ3QMY9 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Top6blJ3QMY9 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Top6blJ3QMY9 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Top6blJ3QMY9 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Top6blJ3QMY9 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Top6blJ3QMY9 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Top6blJ3QMY9 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Top6blJ3QMY9 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Top6blJ3QMY9 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Top6blJ3QMY9 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Top6blJ3QMY9 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Top6blJ3QMY9 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Top6blJ3QMY9 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Top6blJ3QMY9 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Top6blJ3QMY9 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Top6blJ3QMY9 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Top6blJ3QMY9 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Top6blJ3QMY9 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Top6blJ3QMY9 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Top6blJ3QMY9 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Top6blJ3QMY9 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Top6blJ3QMY9 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Top6blJ3QMY9 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Top6blJ3QMY9 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Top6blJ3QMY9 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Top6blJ3QMY9 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Top6blJ3QMY9 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Top6blJ3QMY9 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Top6blJ3QMY9 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Top6blJ3QMY9 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Top6blJ3QMY9 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms