Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930544D05RikJ3QK56 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.8 ms