Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
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Cldn34c3J3QJW5 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Cldn34c3J3QJW5 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Cldn34c3J3QJW5 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Cldn34c3J3QJW5 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Cldn34c3J3QJW5 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Cldn34c3J3QJW5 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn34c3J3QJW5 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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