Protein–RNA interactions for Protein: J3KMR8

Gm17535, Predicted gene, 17535, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17535J3KMR8 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm17535J3KMR8 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms