Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20830J3KML6 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms