Protein–RNA interactions for Protein: G5E861

Sclt1, Sodium channel and clathrin linker 1, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sclt1G5E861 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sclt1G5E861 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sclt1G5E861 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sclt1G5E861 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sclt1G5E861 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sclt1G5E861 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sclt1G5E861 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sclt1G5E861 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sclt1G5E861 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sclt1G5E861 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sclt1G5E861 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sclt1G5E861 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sclt1G5E861 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sclt1G5E861 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sclt1G5E861 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sclt1G5E861 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sclt1G5E861 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sclt1G5E861 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sclt1G5E861 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sclt1G5E861 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sclt1G5E861 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sclt1G5E861 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sclt1G5E861 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sclt1G5E861 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sclt1G5E861 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sclt1G5E861 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sclt1G5E861 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sclt1G5E861 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sclt1G5E861 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sclt1G5E861 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sclt1G5E861 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sclt1G5E861 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sclt1G5E861 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sclt1G5E861 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sclt1G5E861 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sclt1G5E861 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sclt1G5E861 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sclt1G5E861 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sclt1G5E861 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sclt1G5E861 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sclt1G5E861 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sclt1G5E861 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sclt1G5E861 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sclt1G5E861 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sclt1G5E861 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sclt1G5E861 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sclt1G5E861 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sclt1G5E861 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sclt1G5E861 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sclt1G5E861 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sclt1G5E861 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sclt1G5E861 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sclt1G5E861 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sclt1G5E861 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sclt1G5E861 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms