Protein–RNA interactions for Protein: G3X9N3

Pnmal2, MCG16539, mousemouse

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnmal2G3X9N3 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pnmal2G3X9N3 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pnmal2G3X9N3 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pnmal2G3X9N3 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pnmal2G3X9N3 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pnmal2G3X9N3 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pnmal2G3X9N3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pnmal2G3X9N3 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pnmal2G3X9N3 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pnmal2G3X9N3 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pnmal2G3X9N3 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pnmal2G3X9N3 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pnmal2G3X9N3 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pnmal2G3X9N3 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pnmal2G3X9N3 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pnmal2G3X9N3 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pnmal2G3X9N3 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pnmal2G3X9N3 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pnmal2G3X9N3 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pnmal2G3X9N3 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pnmal2G3X9N3 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pnmal2G3X9N3 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pnmal2G3X9N3 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pnmal2G3X9N3 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pnmal2G3X9N3 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pnmal2G3X9N3 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pnmal2G3X9N3 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pnmal2G3X9N3 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pnmal2G3X9N3 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pnmal2G3X9N3 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pnmal2G3X9N3 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pnmal2G3X9N3 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pnmal2G3X9N3 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pnmal2G3X9N3 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pnmal2G3X9N3 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pnmal2G3X9N3 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pnmal2G3X9N3 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pnmal2G3X9N3 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pnmal2G3X9N3 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pnmal2G3X9N3 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pnmal2G3X9N3 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pnmal2G3X9N3 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pnmal2G3X9N3 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pnmal2G3X9N3 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pnmal2G3X9N3 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pnmal2G3X9N3 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pnmal2G3X9N3 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pnmal2G3X9N3 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pnmal2G3X9N3 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pnmal2G3X9N3 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pnmal2G3X9N3 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pnmal2G3X9N3 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pnmal2G3X9N3 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pnmal2G3X9N3 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pnmal2G3X9N3 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pnmal2G3X9N3 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pnmal2G3X9N3 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pnmal2G3X9N3 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pnmal2G3X9N3 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pnmal2G3X9N3 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pnmal2G3X9N3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pnmal2G3X9N3 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pnmal2G3X9N3 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pnmal2G3X9N3 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pnmal2G3X9N3 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pnmal2G3X9N3 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pnmal2G3X9N3 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pnmal2G3X9N3 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pnmal2G3X9N3 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Pnmal2G3X9N3 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Pnmal2G3X9N3 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pnmal2G3X9N3 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pnmal2G3X9N3 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pnmal2G3X9N3 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pnmal2G3X9N3 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pnmal2G3X9N3 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pnmal2G3X9N3 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pnmal2G3X9N3 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pnmal2G3X9N3 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Pnmal2G3X9N3 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Pnmal2G3X9N3 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pnmal2G3X9N3 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pnmal2G3X9N3 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pnmal2G3X9N3 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pnmal2G3X9N3 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pnmal2G3X9N3 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pnmal2G3X9N3 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pnmal2G3X9N3 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pnmal2G3X9N3 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pnmal2G3X9N3 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pnmal2G3X9N3 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pnmal2G3X9N3 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pnmal2G3X9N3 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Pnmal2G3X9N3 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pnmal2G3X9N3 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pnmal2G3X9N3 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pnmal2G3X9N3 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pnmal2G3X9N3 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pnmal2G3X9N3 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pnmal2G3X9N3 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms