Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28048F7BCN0 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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