Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Crocc2F6XLV1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Crocc2F6XLV1 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms