Protein–RNA interactions for Protein: F6VRN1

Smgc, Submandibular gland protein C (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmgcF6VRN1 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
SmgcF6VRN1 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SmgcF6VRN1 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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