Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8F9

6030445D17Rik, RIKEN cDNA 6030445D17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6030445D17RikE9Q8F9 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC9.13□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC9.13□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC9.13□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
6030445D17RikE9Q8F9 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms