Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt78E9Q0F0 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms