Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brd1E9PZ26 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms