Protein–RNA interactions for Protein: E9PW80

Gm3298, Predicted gene 3298, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3298E9PW80 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3298E9PW80 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3298E9PW80 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3298E9PW80 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3298E9PW80 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3298E9PW80 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3298E9PW80 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3298E9PW80 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3298E9PW80 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3298E9PW80 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3298E9PW80 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3298E9PW80 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3298E9PW80 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3298E9PW80 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3298E9PW80 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3298E9PW80 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3298E9PW80 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3298E9PW80 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3298E9PW80 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3298E9PW80 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3298E9PW80 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3298E9PW80 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3298E9PW80 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3298E9PW80 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3298E9PW80 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3298E9PW80 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3298E9PW80 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3298E9PW80 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3298E9PW80 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3298E9PW80 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3298E9PW80 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3298E9PW80 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3298E9PW80 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3298E9PW80 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3298E9PW80 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3298E9PW80 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3298E9PW80 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3298E9PW80 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3298E9PW80 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3298E9PW80 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3298E9PW80 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3298E9PW80 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3298E9PW80 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3298E9PW80 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3298E9PW80 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3298E9PW80 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3298E9PW80 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3298E9PW80 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3298E9PW80 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3298E9PW80 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3298E9PW80 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3298E9PW80 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3298E9PW80 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3298E9PW80 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3298E9PW80 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3298E9PW80 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3298E9PW80 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm3298E9PW80 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm3298E9PW80 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm3298E9PW80 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm3298E9PW80 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm3298E9PW80 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm3298E9PW80 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm3298E9PW80 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm3298E9PW80 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3298E9PW80 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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