Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc144bE9PVZ3 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms