Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Clca3bE9PUL3 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms