Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc8D3YZV8 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107 ms