Protein–RNA interactions for Protein: D3YYP3

Gm6685, Predicted pseudogene 6685, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6685D3YYP3 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm6685D3YYP3 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm6685D3YYP3 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm6685D3YYP3 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm6685D3YYP3 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm6685D3YYP3 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm6685D3YYP3 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm6685D3YYP3 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm6685D3YYP3 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm6685D3YYP3 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm6685D3YYP3 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm6685D3YYP3 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6685D3YYP3 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6685D3YYP3 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6685D3YYP3 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6685D3YYP3 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6685D3YYP3 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6685D3YYP3 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6685D3YYP3 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6685D3YYP3 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6685D3YYP3 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6685D3YYP3 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6685D3YYP3 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6685D3YYP3 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6685D3YYP3 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6685D3YYP3 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6685D3YYP3 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6685D3YYP3 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6685D3YYP3 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6685D3YYP3 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6685D3YYP3 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6685D3YYP3 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6685D3YYP3 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6685D3YYP3 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6685D3YYP3 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6685D3YYP3 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6685D3YYP3 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6685D3YYP3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6685D3YYP3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6685D3YYP3 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6685D3YYP3 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6685D3YYP3 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6685D3YYP3 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6685D3YYP3 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6685D3YYP3 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6685D3YYP3 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6685D3YYP3 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm6685D3YYP3 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm6685D3YYP3 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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