Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rd3lB2RV38 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.5 ms