Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
PtprbB2RU80 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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