Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Zscan5bB2RTN3 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
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