Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Brpf1B2RRD7 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms