Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brpf3B2KF05 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms