Protein–RNA interactions for Protein: A7XUZ6

Skint6, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint6A7XUZ6 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Skint6A7XUZ6 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Skint6A7XUZ6 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Skint6A7XUZ6 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Skint6A7XUZ6 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Skint6A7XUZ6 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Skint6A7XUZ6 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Skint6A7XUZ6 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Skint6A7XUZ6 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Skint6A7XUZ6 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Skint6A7XUZ6 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Skint6A7XUZ6 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Skint6A7XUZ6 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Skint6A7XUZ6 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms