Protein–RNA interactions for Protein: A2TJV2

Palm3, Paralemmin-3, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palm3A2TJV2 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Palm3A2TJV2 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms