Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scn3aA2ASI5 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms