Protein–RNA interactions for Protein: A2ANE1

Rhox3f, Reproductive homeobox 3F, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox3fA2ANE1 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox3fA2ANE1 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox3fA2ANE1 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox3fA2ANE1 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox3fA2ANE1 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox3fA2ANE1 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox3fA2ANE1 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox3fA2ANE1 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox3fA2ANE1 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox3fA2ANE1 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox3fA2ANE1 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox3fA2ANE1 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox3fA2ANE1 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox3fA2ANE1 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox3fA2ANE1 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox3fA2ANE1 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox3fA2ANE1 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox3fA2ANE1 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox3fA2ANE1 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox3fA2ANE1 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox3fA2ANE1 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox3fA2ANE1 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox3fA2ANE1 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox3fA2ANE1 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox3fA2ANE1 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox3fA2ANE1 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox3fA2ANE1 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox3fA2ANE1 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox3fA2ANE1 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox3fA2ANE1 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox3fA2ANE1 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox3fA2ANE1 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox3fA2ANE1 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox3fA2ANE1 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox3fA2ANE1 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox3fA2ANE1 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox3fA2ANE1 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox3fA2ANE1 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox3fA2ANE1 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox3fA2ANE1 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox3fA2ANE1 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox3fA2ANE1 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox3fA2ANE1 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox3fA2ANE1 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox3fA2ANE1 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox3fA2ANE1 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox3fA2ANE1 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox3fA2ANE1 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox3fA2ANE1 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox3fA2ANE1 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox3fA2ANE1 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox3fA2ANE1 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox3fA2ANE1 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox3fA2ANE1 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox3fA2ANE1 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox3fA2ANE1 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox3fA2ANE1 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox3fA2ANE1 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox3fA2ANE1 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox3fA2ANE1 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox3fA2ANE1 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox3fA2ANE1 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox3fA2ANE1 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox3fA2ANE1 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox3fA2ANE1 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox3fA2ANE1 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox3fA2ANE1 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox3fA2ANE1 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox3fA2ANE1 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox3fA2ANE1 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox3fA2ANE1 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox3fA2ANE1 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox3fA2ANE1 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox3fA2ANE1 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox3fA2ANE1 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox3fA2ANE1 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox3fA2ANE1 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox3fA2ANE1 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox3fA2ANE1 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox3fA2ANE1 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox3fA2ANE1 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox3fA2ANE1 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox3fA2ANE1 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox3fA2ANE1 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox3fA2ANE1 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox3fA2ANE1 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox3fA2ANE1 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox3fA2ANE1 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox3fA2ANE1 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox3fA2ANE1 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox3fA2ANE1 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox3fA2ANE1 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox3fA2ANE1 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox3fA2ANE1 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox3fA2ANE1 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox3fA2ANE1 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox3fA2ANE1 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox3fA2ANE1 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox3fA2ANE1 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox3fA2ANE1 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms