Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nlrp1bA1Z198 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nlrp1bA1Z198 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nlrp1bA1Z198 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nlrp1bA1Z198 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nlrp1bA1Z198 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nlrp1bA1Z198 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nlrp1bA1Z198 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrp1bA1Z198 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms