Protein–RNA interactions for Protein: A0A0G2JEU3

Trdc, T cell receptor delta, constant region (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdcA0A0G2JEU3 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TrdcA0A0G2JEU3 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms