Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WSL9

Gm28539, Predicted gene 28539, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28539A0A087WSL9 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28539A0A087WSL9 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28539A0A087WSL9 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28539A0A087WSL9 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28539A0A087WSL9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28539A0A087WSL9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28539A0A087WSL9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28539A0A087WSL9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28539A0A087WSL9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28539A0A087WSL9 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28539A0A087WSL9 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28539A0A087WSL9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28539A0A087WSL9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28539A0A087WSL9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28539A0A087WSL9 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28539A0A087WSL9 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28539A0A087WSL9 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28539A0A087WSL9 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28539A0A087WSL9 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28539A0A087WSL9 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28539A0A087WSL9 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28539A0A087WSL9 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28539A0A087WSL9 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm28539A0A087WSL9 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm28539A0A087WSL9 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm28539A0A087WSL9 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm28539A0A087WSL9 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm28539A0A087WSL9 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm28539A0A087WSL9 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm28539A0A087WSL9 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm28539A0A087WSL9 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm28539A0A087WSL9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm28539A0A087WSL9 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm28539A0A087WSL9 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm28539A0A087WSL9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm28539A0A087WSL9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm28539A0A087WSL9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm28539A0A087WSL9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm28539A0A087WSL9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm28539A0A087WSL9 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm28539A0A087WSL9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm28539A0A087WSL9 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm28539A0A087WSL9 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm28539A0A087WSL9 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm28539A0A087WSL9 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm28539A0A087WSL9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm28539A0A087WSL9 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm28539A0A087WSL9 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm28539A0A087WSL9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm28539A0A087WSL9 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm28539A0A087WSL9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm28539A0A087WSL9 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm28539A0A087WSL9 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm28539A0A087WSL9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm28539A0A087WSL9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm28539A0A087WSL9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm28539A0A087WSL9 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm28539A0A087WSL9 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm28539A0A087WSL9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm28539A0A087WSL9 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm28539A0A087WSL9 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm28539A0A087WSL9 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm28539A0A087WSL9 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm28539A0A087WSL9 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm28539A0A087WSL9 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm28539A0A087WSL9 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm28539A0A087WSL9 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm28539A0A087WSL9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm28539A0A087WSL9 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm28539A0A087WSL9 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm28539A0A087WSL9 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm28539A0A087WSL9 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm28539A0A087WSL9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm28539A0A087WSL9 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm28539A0A087WSL9 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm28539A0A087WSL9 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm28539A0A087WSL9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm28539A0A087WSL9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm28539A0A087WSL9 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm28539A0A087WSL9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm28539A0A087WSL9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm28539A0A087WSL9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm28539A0A087WSL9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm28539A0A087WSL9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm28539A0A087WSL9 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm28539A0A087WSL9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm28539A0A087WSL9 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm28539A0A087WSL9 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm28539A0A087WSL9 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm28539A0A087WSL9 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm28539A0A087WSL9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm28539A0A087WSL9 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm28539A0A087WSL9 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm28539A0A087WSL9 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm28539A0A087WSL9 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm28539A0A087WSL9 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm28539A0A087WSL9 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm28539A0A087WSL9 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm28539A0A087WSL9 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm28539A0A087WSL9 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms