Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WQ89

2210011C24Rik, MCG5930, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2210011C24RikA0A087WQ89 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
2210011C24RikA0A087WQ89 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
2210011C24RikA0A087WQ89 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
2210011C24RikA0A087WQ89 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
2210011C24RikA0A087WQ89 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
2210011C24RikA0A087WQ89 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
2210011C24RikA0A087WQ89 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
2210011C24RikA0A087WQ89 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
2210011C24RikA0A087WQ89 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
2210011C24RikA0A087WQ89 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
2210011C24RikA0A087WQ89 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
2210011C24RikA0A087WQ89 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
2210011C24RikA0A087WQ89 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
2210011C24RikA0A087WQ89 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
2210011C24RikA0A087WQ89 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
2210011C24RikA0A087WQ89 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
2210011C24RikA0A087WQ89 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
2210011C24RikA0A087WQ89 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
2210011C24RikA0A087WQ89 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
2210011C24RikA0A087WQ89 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
2210011C24RikA0A087WQ89 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
2210011C24RikA0A087WQ89 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
2210011C24RikA0A087WQ89 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
2210011C24RikA0A087WQ89 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
2210011C24RikA0A087WQ89 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
2210011C24RikA0A087WQ89 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
2210011C24RikA0A087WQ89 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
2210011C24RikA0A087WQ89 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
2210011C24RikA0A087WQ89 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
2210011C24RikA0A087WQ89 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
2210011C24RikA0A087WQ89 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
2210011C24RikA0A087WQ89 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
2210011C24RikA0A087WQ89 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
2210011C24RikA0A087WQ89 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
2210011C24RikA0A087WQ89 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
2210011C24RikA0A087WQ89 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
2210011C24RikA0A087WQ89 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
2210011C24RikA0A087WQ89 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
2210011C24RikA0A087WQ89 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
2210011C24RikA0A087WQ89 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
2210011C24RikA0A087WQ89 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
2210011C24RikA0A087WQ89 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
2210011C24RikA0A087WQ89 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
2210011C24RikA0A087WQ89 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
2210011C24RikA0A087WQ89 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
2210011C24RikA0A087WQ89 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
2210011C24RikA0A087WQ89 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
2210011C24RikA0A087WQ89 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
2210011C24RikA0A087WQ89 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
2210011C24RikA0A087WQ89 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
2210011C24RikA0A087WQ89 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
2210011C24RikA0A087WQ89 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
2210011C24RikA0A087WQ89 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
2210011C24RikA0A087WQ89 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
2210011C24RikA0A087WQ89 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
2210011C24RikA0A087WQ89 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
2210011C24RikA0A087WQ89 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
2210011C24RikA0A087WQ89 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
2210011C24RikA0A087WQ89 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
2210011C24RikA0A087WQ89 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
2210011C24RikA0A087WQ89 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
2210011C24RikA0A087WQ89 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
2210011C24RikA0A087WQ89 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
2210011C24RikA0A087WQ89 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
2210011C24RikA0A087WQ89 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
2210011C24RikA0A087WQ89 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
2210011C24RikA0A087WQ89 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
2210011C24RikA0A087WQ89 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
2210011C24RikA0A087WQ89 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
2210011C24RikA0A087WQ89 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
2210011C24RikA0A087WQ89 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
2210011C24RikA0A087WQ89 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
2210011C24RikA0A087WQ89 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
2210011C24RikA0A087WQ89 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
2210011C24RikA0A087WQ89 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
2210011C24RikA0A087WQ89 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
2210011C24RikA0A087WQ89 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
2210011C24RikA0A087WQ89 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
2210011C24RikA0A087WQ89 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms