Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Speer3W4VSP1 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Speer3W4VSP1 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Speer3W4VSP1 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Speer3W4VSP1 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Speer3W4VSP1 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Speer3W4VSP1 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Speer3W4VSP1 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Speer3W4VSP1 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Speer3W4VSP1 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Speer3W4VSP1 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Speer3W4VSP1 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Speer3W4VSP1 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Speer3W4VSP1 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Speer3W4VSP1 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Speer3W4VSP1 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Speer3W4VSP1 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Speer3W4VSP1 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Speer3W4VSP1 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Speer3W4VSP1 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Speer3W4VSP1 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Speer3W4VSP1 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Speer3W4VSP1 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Speer3W4VSP1 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Speer3W4VSP1 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Speer3W4VSP1 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Speer3W4VSP1 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Speer3W4VSP1 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Speer3W4VSP1 Vmn1r-ps10-201ENSMUST00000176165 889 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Speer3W4VSP1 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Speer3W4VSP1 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Speer3W4VSP1 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Speer3W4VSP1 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Speer3W4VSP1 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Speer3W4VSP1 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Speer3W4VSP1 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Speer3W4VSP1 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Speer3W4VSP1 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Speer3W4VSP1 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Speer3W4VSP1 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Speer3W4VSP1 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Speer3W4VSP1 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Speer3W4VSP1 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Speer3W4VSP1 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Speer3W4VSP1 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Speer3W4VSP1 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Speer3W4VSP1 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Speer3W4VSP1 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Speer3W4VSP1 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Speer3W4VSP1 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Speer3W4VSP1 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Speer3W4VSP1 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Speer3W4VSP1 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Speer3W4VSP1 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Speer3W4VSP1 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Speer3W4VSP1 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Speer3W4VSP1 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Speer3W4VSP1 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Speer3W4VSP1 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Speer3W4VSP1 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Speer3W4VSP1 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Speer3W4VSP1 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Speer3W4VSP1 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Speer3W4VSP1 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Speer3W4VSP1 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Speer3W4VSP1 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Speer3W4VSP1 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Speer3W4VSP1 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Speer3W4VSP1 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Speer3W4VSP1 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Speer3W4VSP1 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Speer3W4VSP1 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Speer3W4VSP1 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Speer3W4VSP1 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Speer3W4VSP1 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Speer3W4VSP1 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Speer3W4VSP1 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Speer3W4VSP1 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Speer3W4VSP1 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Speer3W4VSP1 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Speer3W4VSP1 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Speer3W4VSP1 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Speer3W4VSP1 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Speer3W4VSP1 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Speer3W4VSP1 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Speer3W4VSP1 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Speer3W4VSP1 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Speer3W4VSP1 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Speer3W4VSP1 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Speer3W4VSP1 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Speer3W4VSP1 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Speer3W4VSP1 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Speer3W4VSP1 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Speer3W4VSP1 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Speer3W4VSP1 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Speer3W4VSP1 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Speer3W4VSP1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Speer3W4VSP1 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Speer3W4VSP1 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Speer3W4VSP1 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms