Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubl3Q9Z2M6 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubl3Q9Z2M6 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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