Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Crlf3Q9Z2L7 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.6 ms