Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mbd1Q9Z2E2 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mbd1Q9Z2E2 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mbd1Q9Z2E2 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms