Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mbd3Q9Z2D8 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mbd3Q9Z2D8 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms