Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0I6

Slfn2, Schlafen 2, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn2Q9Z0I6 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slfn2Q9Z0I6 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slfn2Q9Z0I6 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slfn2Q9Z0I6 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Slfn2Q9Z0I6 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slfn2Q9Z0I6 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Slfn2Q9Z0I6 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Slfn2Q9Z0I6 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slfn2Q9Z0I6 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slfn2Q9Z0I6 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slfn2Q9Z0I6 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Slfn2Q9Z0I6 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Slfn2Q9Z0I6 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slfn2Q9Z0I6 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slfn2Q9Z0I6 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slfn2Q9Z0I6 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slfn2Q9Z0I6 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slfn2Q9Z0I6 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slfn2Q9Z0I6 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slfn2Q9Z0I6 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slfn2Q9Z0I6 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slfn2Q9Z0I6 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slfn2Q9Z0I6 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slfn2Q9Z0I6 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slfn2Q9Z0I6 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slfn2Q9Z0I6 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slfn2Q9Z0I6 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slfn2Q9Z0I6 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slfn2Q9Z0I6 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slfn2Q9Z0I6 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slfn2Q9Z0I6 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slfn2Q9Z0I6 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slfn2Q9Z0I6 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slfn2Q9Z0I6 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slfn2Q9Z0I6 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slfn2Q9Z0I6 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slfn2Q9Z0I6 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slfn2Q9Z0I6 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Slfn2Q9Z0I6 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slfn2Q9Z0I6 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slfn2Q9Z0I6 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slfn2Q9Z0I6 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slfn2Q9Z0I6 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slfn2Q9Z0I6 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slfn2Q9Z0I6 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slfn2Q9Z0I6 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slfn2Q9Z0I6 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slfn2Q9Z0I6 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slfn2Q9Z0I6 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slfn2Q9Z0I6 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slfn2Q9Z0I6 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slfn2Q9Z0I6 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slfn2Q9Z0I6 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn2Q9Z0I6 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn2Q9Z0I6 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn2Q9Z0I6 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn2Q9Z0I6 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn2Q9Z0I6 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn2Q9Z0I6 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn2Q9Z0I6 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn2Q9Z0I6 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn2Q9Z0I6 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn2Q9Z0I6 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn2Q9Z0I6 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn2Q9Z0I6 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn2Q9Z0I6 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn2Q9Z0I6 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn2Q9Z0I6 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn2Q9Z0I6 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn2Q9Z0I6 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn2Q9Z0I6 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn2Q9Z0I6 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn2Q9Z0I6 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn2Q9Z0I6 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms