Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx1Q9WV80 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms