Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR1

Trpv2, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 2, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv2Q9WTR1 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpv2Q9WTR1 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms