Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZW0

Atp11c, Phospholipid-transporting ATPase 11C, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11cQ9QZW0 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp11cQ9QZW0 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms