Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Rnf4Q9QZS2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Rnf4Q9QZS2 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Rnf4Q9QZS2 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf4Q9QZS2 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf4Q9QZS2 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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