Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Npas3Q9QZQ0 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms