Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL6

Usp21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp21Q9QZL6 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms